| Nom | Version | Description | Cours | Architecture | Test |
|---|---|---|---|---|---|
| Zoom | 6.1.11.1545 | Visioconference | Tous | 64 bits | Faire une visio |
| XnViewMP | 1.5 | Explorateur, visualiseur et convertisseur de fichiers image | HSS413G Dessin et animation pour la transmission scientifique | 64 bits | /usr/local/XnViewMP/xnview.sh Ouvrir un dossier contenant des images. |
| xfoil | 6.97 | logiciel de calcul de profil d'aile | mec578 | 64 bits | /usr/local/Xfoil-6.97/bin/xfoil NACA 4415 LOAD /usr/local/Xfoil-6.97/runs/e387.dat GDES QUIT |
| VPython dans Anaconda 3 | 7.6.4 | Visulatisation 3D dans les notebooks jupyter | PHY571 | 64 bits | Le code suivant dans un notebook jupyter devrait marcher: from vpython import * scene.caption = """Right button drag or Ctrl-drag to rotate "camera" to view scene. To zoom, drag with middle button or Alt/Option depressed, or use scroll wheel. On a two-button mouse, middle is left + right. Touch screen: pinch/extend to zoom, swipe or two-finger rotate.""" scene.forward = vector(0,-.3,-1) G = 6.7e-11 giant = sphere(pos=vector(-1e11,0,0), radius=2e10, color=color.red, make_trail=True, trail_type='points', interval=10, retain=20) giant.mass = 2e30 giant.p = vector(0, 0, -1e4) * giant.mass dwarf = sphere(pos=vector(1.5e11,0,0), radius=1e10, color=color.yellow, make_trail=True, retain=40) dwarf.mass = 1e30 dwarf.p = -giant.p dt = 1e5 while True: rate(200) r = dwarf.pos - giant.pos F = G * giant.mass * dwarf.mass * norm(r) / mag2(r) giant.p = giant.p + F*dt dwarf.p = dwarf.p - F*dt giant.pos = giant.pos + (giant.p/giant.mass) * dt dwarf.pos = dwarf.pos + (dwarf.p/dwarf.mass) * dt |
| Visual Studio Code | 1.70.0 | IDE | INF564 mais pas seulement | 64 bits | c'est un IDE : le lancer et écrire au moins une ligne de texte |
| VirtualBox | 7.0.10 | PC virtualization solution | XXX | 64 bits | w7 w11 |
| Vega | 1.2.3 | logiciel de prédiction de toxicité in silico | CHI567 | 64 bits | ouvrir le logiciel |
| Valgrind | 3.19 | Valgrind is an instrumentation framework for building dynamic analysis tools. | INF559 | 64 bits | http://valgrind.org gcc toto.c -o toto valgrind --leak-check=yes ./toto $ more toto.c #include <stdlib.h> void f(void) { int* x = malloc(10 * sizeof(int)); x[10] = 0; // problem 1: heap block overrun } // problem 2: memory leak -- x not freed int main(void) { f(); return 0; } |
| Uppaal | 5.0.0 | Model-checking | INF575 | 64 bits | Lancer uppaal en ligne de commande |
| Unity - Unity Hub | 2022.3.5f1 - 3.5.0 | Modélisation et programmation 3D | INF633 - Advanced 3D Graphics | 64 bits | - Créer un projet > Projects > New > Create - Tester l'éditeur de texte > Dans la fenêtre "Project", clic droit > Create > C# script > Double cliquer sur le fichier, MonoDevelop doit s'ouvrir - Tester l'autocomplétion > Dans monodevelop, dans une fonction, taper "Inpu", une popup devrait s'ouvrir pour compléter "Input" |
| Triangle | GIT | Python Triangle is a python wrapper around Jonathan Richard Shewchuk’s two-dimensional quality mesh generator and delaunay triangulator library | MAP 584 | 64 bits | import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import triangle as tr A = dict(vertices=np.array(((0, 0), (1, 0), (1, 1), (0, 1)))) B = tr.triangulate(A) tr.compare(plt, A, B) plt.show() |
| TEST | 5.1 | logiciel de prédiction de toxicité in silico | CHI567 | 64 bits | lancer le logiciel |
| Swig | 4.0.2 | Compilateur interface entre C/C++ et Python | MEC578 | 64 bits | Voir le lien de téléchargement |
| SWI Prolog | 8.4.3 | Compilateur Prolog | CSE 301 | 64 bits | > swipl --version SWI-Prolog version 8.4.3 for x86_64-linux |
| StataNow | 19 | Logiciel d'analyse des données et de statistique | ECO | 64 bits | xstata stata |
| Spyder-unittest pour Anaconda3 | 0.6.0 | Plugin pytest pour spyder. | CSE101 | 64 bits | voir Benjamin Smith |
| SPICEOPUS | 3.0.405 | Simulation spice. simulation de circuits électriques | PHY559A | 64 bits | ouverture de l'application avec la commande spiceopus |
| Sparky | 3.115 | NMR Assignment and Integration Software | BIO_2F001_EP | 64 bits | par l'enseignante |
| SLURM | 24.11 | Logiciel de gestion de grappe de calcul | INF560 | 64 bits | Lancement d'une commande SLURM de base : srun -N 2 -n 4 hostname -> Création de 4 processus sur 2 noeuds de calcul (machines) Affichage attendu : 4 lignes avec 2 hostnames différents |
| SCons | 4.5.2 | Outil de construction et compilation de logiciels | MEC578 | 64 bits | $ scons --version SCons by Steven Knight et al.: script: v2.5.1.rel_2.5.1:3735:9dc6cee5c168[MODIFIED], 2016/11/03 14:02:02, by bdbaddog on mongodog engine: v2.5.1.rel_2.5.1:3735:9dc6cee5c168[MODIFIED], 2016/11/03 14:02:02, by bdbaddog on mongodog engine path: ['/usr/lib/scons/SCons'] Copyright (c) 2001 - 2016 The SCons Foundation |
| SAS | 9.4 | Logiciel d'analyse statistique | ECO | 64 bits | sas |
| Rstudio Desktop | 2023.06.1-524 | environnement de développement pour R | CHI663 | 64 bits | cf Step 3 à l'adresse http://mixomics.org/wp-content/uploads/2016/09/Installation-guide-for-R-and-RStudio.pdf |
| R (RPM) | 4.3.1 | Outil de manipulation de données, de graphiques et de calcul | ECO | 64 bits | R |
| Qucs-S | 1.1.0 | simulation de composants et de circuit électronique | PHY559A; PHY564A | 64 bits | me contacter |
| Quarto | 1.6.40 | Système de publication technique et scientifique | CHI663 | 64 bits | Exécuter => quarto check |
| QtCreator | 8.0.1 | IDE de programmation C++ | INF443, INF585, INF473N | 64 bits | Lancement de l'IDE sans erreurs apparente. |
| QGIS | -tpr- 3.2 | https://www.qgis.org/fr/site/forusers/download.html | ECO512 | 64 bits | n/a |
| QGIS | -tpr- 2.14.9 et (3.22.3 via VM) | Analyse de données géographiques | GIS and public policie | 64 bits | RAS |
| qemu | 10.0.0 | Emulateur x86 | INF559 | 64 bits | /usr/local/qemu-10.0.0 |
| Pymol | 2.5.0 | Visualisation moléculaire | BIO651A - Bioinformatique structurale | 64 bits | wget http://www.rcsb.org/pdb/files/1ABO.pdb pymol 1ABO.pdb |
| Processing | 4.2 | Environnement de programmation en java (ou python), dédié à l'utilisation des librairies facilitant la création graphique et interactive | Dessin et animation pour la transmission scientifique | 64 bits | Aller dans Fichier > Exemples Puis naviguer dans Basics > Images Ouvrir (par exemple) "Alphamask" Lancer le programme avec le bouton Play, et passer la souris sur la nouvelle fenêtre: deux images doivent se superposer. |
| PostgreSQL | 17.2 | Base de données relationelle | INF553 | 64 bits | Voir les instructions d'installation mkdir -p /Data/pgsql-tbp/data /usr/local/postgresql/bin/initdb -D /Data/pgsql-tbp/data /usr/local/postgresql/bin/pg_ctl -D /Data/pgsql-tbp/data -l /Data/pgsql-tbp/logfile start /usr/local/postgresql/bin/createdb test /usr/local/postgresql/bin/psql test /usr/local/postgresql/bin/pg_ctl -D /Data/pgsql-tbp/data -l /Data/pgsql-tbp/logfile stop |
| phpMyAdmin | 5.2.1 | Gestion de Mysql via web | Modal web et tablette | 64 bits | Voir page http://www.enseignement.polytechnique.fr/amp/ |
| ParaView | 5.11.1 | Visualisation de données scientifiques | MEC554 et MEC578 | 64 bits | Lancer le soft |
| OpenMPI | 4.1.5 | OpenMPI | MEC578 et MEC554 | 64 bits | $ more PremierMPI.cpp #include <iostream> #include <mpi.h> int main (int argc, char *argv[]) { int id, p, name_len; char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME]; MPI_Init(&argc, &argv); MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &p); MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &id); MPI_Get_processor_name(processor_name, &name_len); std::cout << "Processeur " << processor_name << " ID = " << id << " bienvenue en INF442 !" << std::endl; MPI_Finalize(); return 0; } [test-253 tmp]$ mpic++ PremierMPI.cpp -o PremierMPI [test-253 tmp]$ mpirun PremierMPI Processeur test-253.polytechnique.fr ID = 0 bienvenue en INF442 ! Processeur test-253.polytechnique.fr ID = 1 bienvenue en INF442 ! Processeur test-253.polytechnique.fr ID = 2 bienvenue en INF442 ! Processeur test-253.polytechnique.fr ID = 3 bienvenue en INF442 ! |
| OpenFOAM | 2306 | logiciel de simulation numérique mécanique des fluides open source | PSC ecoshell marathon | 64 bits | il y a des tutoriaux, il suffit de lancer un cas. je peux m'en occuper. -------------------- source /usr/lib/openfoam/openfoam2306/etc/bashrc blockMesh -help |
| opam | 2.1.5 | gestion de packages pour OCaml | INF551, INF441, INF564 | 64 bits | opam init --disable-sandboxing ----- opam init opam install menhir |
| OCaml | 4.11.1 | Language de programmation | INF441, INF564 | 64 bits | /usr/local/ocaml-4.04.1 |
| Netbeans | 18 | IDE PHP, Java, ... | Tous | 64 bits | netbeans |
| nemiver | 0.9.6 | debugger x86-64 | INF564 | 64 bits | lancer la commande "nemiver" sans argument doit ouvrir une fenêtre graphique, avec un menu et des onglets dans la partie droite indiquant "Target terminal", "Context", etc. |
| Natron | 2.5.0 | Logiciel de compositing open-source de L'Inria | Dessin et animation pour la transmission scientifique | 64 bits | Simplement ouvrir Natron Plus poussé: télécharger le fichier d'exemple NatronDemoProject.zip et ouvrir Spaceship_Natron.ntp |
| Morpheus | derniere (2.3.8) | Logiciel de simulation de phenomene biologique multicelluraire et multiechelle | BIO_2F001_EP | 64 bits | A minima lancer le GUI; plus pousser clicker sur le menu 'exemples->ODE->cell cyle' et clicker sur 'run' devrait lancer la simulation et divers fichier résultats devrait apparaître dans la fenêtre au centre. |
| Molden | 6.9 | Logiciel de visualisation | CHI563 | 64 bits | Il suffit d'exécuter molden pour voir si l'interface graphique se lance. |
| MedeA | 2.21 | package for atomistic-scale simulation of materials | PHY570, PHY552A, PHY663 | 64 bits | voir site |
| Matlab | R2023b | Plateforme de calcul numérique et de programmation | Tous | 64 bits | matlab |
| Mathematica | 14 | Calcul formel | PHY569C | 64 bits | mathematica |
| LLVM | 19.1.4 | compilateur C/C++ et sanitizer | INF559 | 64 bits | Example avec instructions : https://clang.llvm.org/docs/AddressSanitizer.html # cat example_UseAfterFree.cc int main(int argc, char **argv) { int *array = new int[100]; delete [] array; return array[argc]; // BOOM } # Compile and link /usr/local/llvm-19.1.0/bin/clang++ -O1 -g -fsanitize=address -fno-omit-frame-pointer example_UseAfterFree.cc # Symbolizing the Reports ASAN_SYMBOLIZER_PATH=/usr/local/llvm-19.1.0/bin/llvm-symbolizer ./a.out |
| librairies pour python : matplotlib, mpi4py, scipy | les dernières version disponibles | libriaries pour la visualisation de résultats (matplotlib), le calcul parallel (mpi4py), le calcul scientifique (scipy) | MEC578 | 64 bits | SO |
| libasan / libubsan | Peu importe | Address Sanitizer / Undefined Behavior Sanitizer for gcc | INF471S | 64 bits | Créez un fichier C++ simple main.c (non vide) et tentez de le compiler avec g++ -main.c -fsanitize=address -fsanitize=undefined -o main |
| Julia | 1.9.3 | Scientific computing | INF575 | 64 bits | - Executer "julia" en ligne de commande et executer une instruction basique cf https://docs.julialang.org/en/v1/manual/getting-started/ - Idéalement j'aimerais que les eleves puissent executer des notebooks Julia (et donc pas seulement en session interactive comme ci-dessus) * Par exemple sous Visual Studio Code qui je vois est installé (mais il faut installer l'extension Julia, je ne sais pas si on peut le faire sur son compte une fois Julia installé ou si vous devez le faire pour nous?) cf https://www.julia-vscode.org * Ou alors par Jupyter ? cf https://julialang.github.io/IJulia.jl/stable/manual/running/ Auquel cas comme test, sous le "julia" interactif: using IJulia notebook() Merci ! |
| jflex | 1.9.1 | analyseur lexical pour Java | INF564 | 64 bits | Télécharger et décompresser https://www.enseignement.polytechnique.fr/informatique/INF564/td/2-java/mini-python-java.tar.gz Puis faire - cd mini-python-java/ - jflex src/mini_python/Lexer.flex Doit afficher quelques lignes se terminahnt par Writing code to "src/mini_python/Lexer.java" (désolé je n'ai pas trouvé plus simple) |
| JavaFX | 21.0.3 | Lib Interface graphique | INF371 | 64 bits | Dans mes tests, ça fonctionne : [cher ~]$ export PATH=/usr/lib/jvm/java-21-openjdk-21.0.3.0.9-1.el9.alma.1.x86_64/bin/:$PATH [cher ~]$ export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-21-openjdk-21.0.3.0.9-1.el9.alma.1.x86_64 [cher ~]$ export PATH_TO_FX=/usr/local/javafx-sdk-21.0.3/lib [cher ~]$ java --version [cher ~]$ wget https://raw.githubusercontent.com/openjfx/samples/master/HelloFX/CLI/hellofx/HelloFX.java -O HelloFX.java [cher ~]$ javac --module-path $PATH_TO_FX --add-modules javafx.controls HelloFX.java [cher ~]$ java --module-path $PATH_TO_FX --add-modules javafx.controls HelloFX Il est préférable de faire ce genre de demande sur le site https://www.enseignement.polytechnique.fr/software-si/ (pour avoir une certaine traçabilité) |
| Jalview | 2.11.2.0 | Logiciel d'édition, de visualisation et d'analyse d'alignement de séquences | BIO | 64 bits | jalview |
| HDF5 | 1.10.8 | Librairie de gestion de format de fichiers (lecture et écriture) | MEC554 | 64 bits | Sans objet |
| Graphviz | 2.44 | Visualisation de graphes | INF et BIOINF | 64 bits | vi test.py import networkx as nx G = nx.complete_graph(5) print(G.edges()) A = nx.nx_agraph.to_agraph(G) A.layout(prog='dot') #A.write('graphe.dot') A.draw('graphe.pdf') /usr/local/anaconda3/bin/python3 test.py xpdf graphe.pdf |
| GMSH | 4.11.1 | outil de maillage pour la simulation numérique en mécanique | PSC ecoshell marathon | 64 bits | ras |
| GLFW | 3.3.7 | Librairie C pour la création de fenêtres avec contexte OpenGL | INF443, INF585, INF630 | 64 bits | main.cpp ============================================ #include <GLFW/glfw3.h> int main() { glfwInit(); GLFWwindow* window = glfwCreateWindow(500, 500, "My Window", NULL, NULL); while( !glfwWindowShouldClose(window) ) { glfwSwapBuffers(window); glfwPollEvents(); } glfwTerminate(); return 0; } ============================================ $ gcc main.cpp -o pgm -lglfw $ ./pgm (devrait ouvrir une fenêtre) |
| Glasgow Haskell Compiler | 9.6.2 | compiler and interpreter for the Haskell language | CSE301 Functional Programming | 64 bits | $ ghci GHCi, version 8.8.4: https://www.haskell.org/ghc/ :? for help Loaded package environment from [...] Loaded GHCi configuration from [...] Prelude> reverse "Hello world!" "!dlrow olleH" Prelude> :quit Leaving GHCi. $ (echo 'main :: IO ()' && echo 'main = do' && echo ' putStrLn "Hello world!"') > Hello.hs $ ghc Hello.hs Loaded package environment from [...] [1 of 1] Compiling Main ( Hello.hs, Hello.o ) Linking Hello ... $ ./Hello Hello world! |
| gfortran | 11.3.1 | compilateur fortran | MEC 578 | 64 bits | ras |
| gdb | 15.2 | Debugger | INF559 | 64 bits | https://www.gnu.org/software/gdb/ |
| gcc | 14.2.0 | Compilateur C | INF559 && CSE305 | 64 bits | https://gcc.gnu.org |
| Gaussian | 09 | Calculs de chimie quantique | CHI563 chimie 3A | 64 bits | Gaussian se trouve dans /users/misc-b/g09 |
| FreeFem++ | 4.13 | Solveur d'équations différentielles par éléments finis | MEC578 | 64 bits | Télécharger les exemples et en exécuter un Si l'exemple est dans le fichier toto.edp, lancer FreeFem++ toto.edp |
| FIJI | last | Analyse d'image biologique | BIO201 | 64 bits | Vérifier que le programme se lance et que la mise a jour automatique fonctionne. |
| FFMpeg | 7.1 | FFMPEG | BR / JTX / e-learning | 64 bits | $ LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64 /usr/local/ffmpeg-6.0/bin/ffmpeg -h encoder=libaom-av1 ffmpeg version 6.0 Copyright (c) 2000-2023 the FFmpeg developers built with gcc 11 (GCC) configuration: --pkg-config-flags=--static --extra-libs=-lpthread --extra-libs=-lm --enable-gpl --enable-libfdk_aac --enable-libfreetype --enable-libmp3lame --enable-libopus --enable-libvorbis --enable-libvpx --enable-libx264 --enable-libx265 --enable-cuda --enable-cuvid --enable-nonfree --enable-libnpp --enable-libaom --extra-cflags=-I/usr/local/ffnvcodec/include --extra-cflags=-I/usr/local/lame-3.100/include --extra-cflags=-I/usr/local/libvpx/include --extra-cflags=-I/usr/local/libvorbis-1.3.7/include --extra-cflags=-I/usr/local/libogg-1.3.5/include --extra-cflags=-I/usr/local/opus-1.3.1/include --extra-cflags=-I/usr/local/x265/include --extra-cflags=-I/usr/local/x264/include --extra-cflags=-I/usr/local/fdk-aac/include --extra-cflags=-I/usr/local/cuda/include --extra-ldflags=-L/usr/local/lame-3.100/lib --extra-ldflags=-L/usr/local/libvpx/lib --extra-ldflags=-L/usr/local/libvorbis-1.3.7/lib --extra-ldflags=-L/usr/local/libogg-1.3.5/lib --extra-ldflags=-L/usr/local/opus-1.2.1/lib --extra-ldflags=-L/usr/local/x265/lib --extra-ldflags=-L/usr/local/x264/lib --extra-ldflags=-L/usr/local/fdk-aac/lib --extra-ldflags=-L/usr/local/cuda/lib64 --prefix=/usr/local/ffmpeg-6.0 .... |
| Eclipse | 2023-06 | Eclipse | INF411, INF553, etc | 64 bits | eclipse |
| Da Vinci Resolve | 18.1.4 | Logiciel de montage, compositing, étalonnage | HSS413G Dessin et animation pour la transmission scientifique | 64 bits | Simplement lancer le logiciel. Je ferai les tests suivants |
| cytoscape | 3.10.2 | Network visualisation | BIO_2F001_EP | 64 bits | par l'enseignante |
| cup | 0.11b | analyseur syntaxique pour Java | INF564 | 64 bits | Télécharger et décompresser https://www.enseignement.polytechnique.fr/informatique/INF564/td/2-java/mini-python-java.tar.gz puis exécuter les commandes - cd mini-python-java - rm src/mini_python/parser.java - make Doit afficher plusieurs lignes se terminant par Code written to "parser.java", and "sym.java". |
| CUDA | 12.6.3 | CUDA Toolkit | Tous | 64 bits | #export PATH=/usr/local/cuda/bin:${PATH:+:${PATH}} #export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}} #cuda-install-samples-11.4.sh /tmp/test #cd /tmp/test/NVIDIA_CUDA-11.4_Samples/5_Simulations/nbody #GLPATH=/usr/lib64 make #./nbody https://github.com/NVIDIA/cuda-samples |
| cmake | 3.31.1 | cmake | Software compilation | 64 bits | /usr/local/cmake-3.31.1/bin/cmake --version |
| Chimera X | 1.8 | Protein structure visualisation | BIO_2F001_EP | 64 bits | par l'enseignant |
| CGNS | 4.3.0 | Mise en forme et traitement de données pour la simulation numérique en mécanique des fluides (CFD) | MEC578 | 64 bits | Voir lien |
| ccp4 | 9.0 | Macromolecular X-Ray Crystallography | BIO_2F001_EP | 64 bits | par l'enseignante |
| Cassiope | 3.6 | logiciel de pre et post traitement pour la simulation en aerodynamique | mec578 | 64 bits | so |
| cabal | 3.10.1.0 | package manager for Haskell | CSE301 | 64 bits | cabal update cabal install --lib random |
| Bochs | 2.7 | Emulateur x86 | INF559 | 64 bits | http://bochs.sourceforge.net |
| avogadro | 1.98.1 | Avogadro is an advanced molecule editor and visualizer designed for cross-platform | CHI 563 | 64 bits | ras |
| Anaconda3 | 2024.10 | Anaconda3 + packages | Tous | 64 bits | source /usr/local/anaconda3/conda_init ... |
| AMPL | 20220812 | mathematical modeling language | INF569 | 64 bits | à partir du directoire "models" taper ampl cut2.run |
| AMPL | 2023.12.14 | algebraic modeling language | INF569 | 64 bits | ampl gurobi à partir du répertoire "models" taper : ampl cut2.run |